Viernes 25 de Octubre a las 14:30 horas. Blanco Encalada #2120, sala B105.
Los invitamos a un nuevo seminario MOAI-Bio, organizado por el Centro de Modelamiento Matemático (CMM) de la Universidad de Chile.
Nuestras dos charlas serán:
Dr. Cristian Salgado PMDC Lab – Departamento de Ingeniería Química y Biotecnología – Universidad de Chile. |
¿Cómo convivir con wet labs cuando tu laboratorio es un dry lab? En esta charla se presentarán las principales lineas de investigación llevadas a cabo en el PMDC Lab (Process Modeling and Distributed Computing Lab). Entre ellas se pueden mencionar el modelamiento y simulación de sistemas biológicos, la biología de sistemas, la bioinformática y la modelación molecular. Se presentarán ejemplos de los trabajos más representativos desarrollados en el laboratorio asociados a tales líneas, algunos de ellos con colaboraciones exitosas con miembros del CMM. En particular, se presentará en detalle el proyecto asociado a la modelación matemática del sistema de absorción de hierro en células epiteliales, ubicando el énfasis en los procesos relacionados a la incorporación de hierro en la proteína Ferritina, parte fundamental de este sistema. |
Dr. Nicolas Loira Centro de Regulación del Genoma; CIRIC-INRIA Chile |
Métodos de reconstrucción de modelos metabólicos y sus aplicaciones En mi charla presentaré dos métodos de reconstrucción de modelos metabólicos a escala completa, seguido de aplicaciones a la biominería y producción de biocombustibles. El primer método (Pantograph) permite generar modelos metabólicos de alta calidad en base a similitud con modelos existentes. El segundo método (Meneco++) permite completar automáticamente modelos disconexos usando bases de datos de reacciones. Presentaré además los modelos metabólicos que hemos reconstruido utilizando estos métodos, incluyendo aplicaciones a la biominería (A. ferrooxidans) y a la producción de biocombustibles (Y. lipolytica, N. salina y E. siliculosus). Incluiré una guía básica de reconstrucción de modelos metabólicos en base a información genómica. |
Fecha: Viernes 25 de Octubre, a las 14:30 horas
Lugar: Blanco Encalada #2120 (sala B105), Santiago